新一代益生菌Akk在兩種培養(yǎng)基中的生長(zhǎng)情況與差異性代謝組學(xué)分析結(jié)果(一)
嗜黏蛋白阿克曼菌(Akkermansia muciniphila,Akk)被稱作新一代益生菌,是一種典型的哺乳動(dòng)物腸道菌,依賴于腸道上皮細(xì)胞分泌的黏蛋白生存,是腸道黏液層的關(guān)鍵微生物,更與多種疾病存在重要關(guān)聯(lián)。Akk作為一種典型的腸道菌,只能耐受低濃度的氧氣,其體外培養(yǎng)更是生長(zhǎng)周期長(zhǎng)、生長(zhǎng)速度慢。本團(tuán)隊(duì)研究發(fā)現(xiàn),Akk可利用硫乙醇酸鹽液體培養(yǎng)基,且該培養(yǎng)基成分簡(jiǎn)單價(jià)格便宜,唯其生長(zhǎng)速度較為緩慢。
東北農(nóng)業(yè)大學(xué)食品學(xué)院,乳品科學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的武曉玲、徐珒昭、許曉曦*等人利用非靶向代謝組學(xué)技術(shù)對(duì)比分析Akk在硫乙醇酸鹽液體培養(yǎng)基和優(yōu)化培養(yǎng)基中代謝產(chǎn)物的差異,結(jié)合京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路探究其特征性代謝產(chǎn)物與疾病的關(guān)聯(lián),并以此證明優(yōu)化培養(yǎng)基在工業(yè)化高密度培養(yǎng)中的優(yōu)勢(shì)及應(yīng)用前景,旨在為Akk在中國的工業(yè)化生產(chǎn)提供科學(xué)基礎(chǔ)。
1 Akk在兩種培養(yǎng)基中的生長(zhǎng)情況對(duì)比
由于Akk在硫乙醇酸鹽液體培養(yǎng)基中生長(zhǎng)其菌液密度極低(生長(zhǎng)速度慢且活菌數(shù)較少),因此本課題組前期在硫乙醇酸鹽液體培養(yǎng)基的基礎(chǔ)上,對(duì)Akk培養(yǎng)基進(jìn)行優(yōu)化。為確定Akk在兩種培養(yǎng)基中的生長(zhǎng)穩(wěn)定期以制備發(fā)酵上清液樣本,并對(duì)比Akk在兩種培養(yǎng)基中的生長(zhǎng)情況,通過測(cè)定菌液OD600 nm并繪制生長(zhǎng)曲線,結(jié)果如圖1所示。
由圖1可知,0~8 h為Akk的生長(zhǎng)遲緩期,12 h左右進(jìn)入生長(zhǎng)對(duì)數(shù)期。在硫乙醇酸鹽液體培養(yǎng)基中,Akk生長(zhǎng)對(duì)數(shù)期為12~32 h,32 h菌液OD600 nm達(dá)到最高(0.269±0.003),之后進(jìn)入穩(wěn)定期,穩(wěn)定期活菌數(shù)為6.75×107 CFU/mL。而在優(yōu)化培養(yǎng)基中的生長(zhǎng)對(duì)數(shù)期同樣在12 h左右進(jìn)入對(duì)數(shù)期,44 h時(shí)菌液OD600 nm最高可達(dá)0.761±0.011,是硫乙醇酸鹽液體培養(yǎng)基的2.83倍,并在44 h之后趨于穩(wěn)定,穩(wěn)定期的活菌數(shù)為1.74×109 CFU/mL,比硫乙醇酸鹽液體培養(yǎng)基高出2個(gè)數(shù)量級(jí)。由此可知,優(yōu)化后的培養(yǎng)基雖相對(duì)延長(zhǎng)了Akk的對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,但顯著提高了Akk的菌液密度及活菌數(shù)。并由此選擇其在硫乙醇酸鹽液體培養(yǎng)基和優(yōu)化培養(yǎng)基中進(jìn)入生長(zhǎng)旺盛期的32 h和44 h發(fā)酵上清液,用以分析兩組樣本的差異代謝物。
2差異性代謝組學(xué)分析結(jié)果
2.1 QC分析
為評(píng)價(jià)儀器的穩(wěn)定性及數(shù)據(jù)質(zhì)量的可靠性,分別在正負(fù)離子模式下將QC樣本總離子流圖進(jìn)行譜圖重疊比較,結(jié)果如圖2所示。結(jié)果表明兩種模式下各色譜峰的響應(yīng)強(qiáng)度和保留時(shí)間均基本重疊,說明在整個(gè)實(shí)驗(yàn)過程中儀器誤差引起的變異較小,實(shí)驗(yàn)結(jié)果較為可靠。
2.2代謝物鑒定數(shù)量及化學(xué)分類歸屬統(tǒng)計(jì)
通過高效液相色譜-串聯(lián)飛行時(shí)間質(zhì)譜聯(lián)用儀檢測(cè)Akk在兩種培養(yǎng)基發(fā)酵上清液中的代謝產(chǎn)物,正負(fù)離子模式下合計(jì)鑒定到代謝產(chǎn)物2 253種,其中正離子模式下鑒定到代謝產(chǎn)物1 585種,負(fù)離子模式下鑒定到668種。根據(jù)化學(xué)分類歸屬信息將所有代謝物進(jìn)行分類統(tǒng)計(jì),各類代謝物數(shù)量所占比例如圖3所示。
兩組樣本中檢測(cè)到的代謝物包括有機(jī)酸及其衍生物(34.976%),脂質(zhì)和脂質(zhì)類分子(21.127%),有機(jī)雜環(huán)化合物(10.567%),苯甲酸類(6.569%),有機(jī)氧化合物(5.237%),苯丙烷和聚酮(4.172%),核苷、核苷酸和類似物(2.308%),有機(jī)氮化合物(1.243%),生物堿及其衍生物(0.666%),木質(zhì)素、新木質(zhì)素及相關(guān)化合物(0.178%),有機(jī)金屬化合物(0.133%),有機(jī)硫化合物(0.133%),烴類衍生物(0.089%)和未命名化合物(12.605%)等。
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