鵪鶉肺炎克雷伯菌血清型鑒定、耐藥性檢測及致病潛力（二）
1.516SrDNA鑒定和遺傳進化分析
使用細菌基因組DNA提取試劑盒提取純培養菌株的全基因組，參考Colodner等方法使用16SrDNA通用引物27F（5‘-AGAGTTTGATC-MTGGCTCAG-3’）和1492R（5‘-GGTTACCTTG-TTACGACTT-3’）進行PCR擴增，PCR反應體系25μL:2×EasyTaqPCRSuperMix（+Dye）12.5μL,上、下游引物各0.6μL,DNA模板1.0μL,ddH2O10.3μL.PCR擴增程序：94℃預變性5min;94℃變性30s,54℃退火30s,72℃延伸30s,共35個循環；72℃延伸10min;4℃保存。PCR產物用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測，并送至生工生物工程（上海）股份有限公司進行測序拼接，測序結果在NCBI中BLAST進行序列比對，使用Mega11.0軟件構建系統進化樹。
1.6肺炎克雷伯菌特異性
基因檢測以提取的細菌DNA為模板，參考吳自豪等研究報道的引物（F1:5‘-CGATTCTGGAAATGG-CAAAAG-3’；R1:5‘-CGTGATCAGCGGTGACT-ATGAC-3’），對腸桿菌科特異性基因phoA進行PCR擴增，預期擴增產物大小為720bp.PCR反應體系及程序同1.5,其中退火溫度為58℃。參考王樂等方法，使用特異性引物（F2:5‘-TGA-TTGCATTCGCCACTGG-3’；R2:5‘-GGTCAACC-CAACGATCCTG-3’）對肺炎克雷伯菌溶血菌素基因khe進行PCR擴增，預期擴增產物大小為498bp.PCR反應體系及程序同1.5,其中退火溫度為56℃。PCR擴增產物用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測。
1.7肺炎克雷伯菌莢膜血清型檢測
參考解秀梅等研究合成肺炎克雷伯菌7種常見莢膜血清型引物，PCR反應體系及程序同1.5,退火溫度見表1.PCR擴增產物通過1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測。
表1肺炎克雷伯菌莢膜血清型引物序列
1.8藥物敏感性檢測
使用K-B法檢測分離菌株對β-內酰胺類、四環素類、氯霉素類、多肽類、氨基糖苷類、磺胺類、喹諾酮類以及大環內酯類等9大類24種常見抗菌藥物的敏感性。用無菌涂布器將純培養菌液均勻涂布于LB瓊脂培養基，并在 oCelloScope 中于 37°C 下培養（無需搖動）。每 30分鐘至 10 小時采集一次圖像。每個樣品一式三份進行分析，并計算平均值和標準差。
1.9耐藥基因檢測
參考文獻合成肺炎克雷伯菌5大類11種耐藥基因引物，PCR反應體系及程序同1.5,退火溫度見表2.PCR擴增產物進行1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測。
表2耐藥基因引物序列
1.10毒力基因檢測參考文獻合成肺炎克雷伯菌18種毒力基因特異性引物，利用PCR擴增檢測分離株攜帶毒力基因情況。PCR反應體系及程序同1.5,退火溫度見表3,PCR產物進行1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測。
表3毒力基因引物序列
1.11生物學特性分析
1.11.1生長曲線測定
實驗中，將過夜培養的細菌稀釋至初始細胞密度為104CFU/mL,然后將不同濃度的XO和LPO添加到96孔板中，每種條件設置三份重復。oCelloScope被放置在37°C、5%CO?的培養箱中，每隔15分鐘對每個孔進行兩次掃描，持續監測24小時。通過背景校正的吸收算法，生成細菌生長曲線，并計算每個時間點的平均增長量。以接種時間為橫軸、D600nm值為縱軸繪制細菌生長曲線。
1.11.2酸堿耐受性測定
取150μL純培養菌液分別接種于5mLpH為2.0、3.0、4.0、5.0、6.0、7.0、8.0、9.0、10.0、11.0、12.0的LB肉湯培養基，于37℃、180r/min搖床孵育24h,使用丹麥Biosense微生物動態曲線監測系統測定菌液D600nm值，試驗設置3個重復，取平均值，利用Origin2024軟件作圖，以pH為橫軸、D600nm值為縱軸繪制pH穩定曲線。
1.11.3接種量測定
分別向5mLLB肉湯培養基中加入50、100、150、200、250μL純培養菌液，使接種量依次達到培養基體積的1%、2%、3%、4%、5%,于37℃、180r/min搖床孵育12h,使用丹麥Biosense微生物動態曲線監測系統測定菌液D600nm值，試驗設置3個重復，取平均值，利用Origin2024軟件作圖，以接種量為橫軸、D600nm值為縱軸繪制接種曲線。
1.12致病性試驗
將分離菌接種于LB液體培養基中，并于最適條件下培養，隨后進行平板計數，并計算其菌液濃度，按照測定結果，將菌液稀釋成不同濃度（1×105、1×106、1×107、1×108、1×109CFU/mL）。將120只小鼠分為12組，其中2組為對照組，其余10組為不同濃度菌株處理組（每株菌5個濃度組），每組10只小鼠。對照組小鼠注射0.5mL生理鹽水，其他各組小鼠分別注射不同濃度菌液（0.5mL/只）。攻毒12h后開始觀察，記錄1周內小鼠發病和死亡情況，用寇氏改良法計算分離菌株對小鼠的半數致死量（LD50）。
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